釜山国立大学开发变异感知型CRISPR脱靶预测工具
2025-07-02 15:44
来源:釜山国立大学
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釜山国立大学Jeongbin Park教授团队开发出新型基因组编辑脱靶预测工具"变异感知型Cas-OFFinder"。这项发表在《核酸研究》期刊的技术突破,通过整合个体基因变异数据,提高了CRISPR编辑的精准度。研究人员推出了一款基于网络的工具——变异感知型 Cas-OFFinder,它能够通过整合个体遗传差异来改进 CRISPR 脱靶预测。通过重建等位基因特异性序列,该工具能够提供单倍型水平的洞察,从而在医学、农业和科研领域实现更安全、更精准的基因组编辑。

该工具由博士生Abyot Melkamu Mekonnen和硕士生Kang Seong共同开发,能够分析单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失等变异对脱靶效应的影响。"基因组编辑工具应该像它们所针对的基因组一样个性化,"Park教授表示。相比传统依赖标准参考基因组的方法,新技术可识别个体特异性脱靶位点。

研究团队在人类基因组测试中发现10号染色体上被传统方法遗漏的脱靶位点,并在甜椒基因组中检测到等位基因特异性脱靶。该工具支持557个物种和40种PAM类型,提供网页界面和命令行版本。

更多信息: Abyot Melkamu Mekonnen 等人,《变异感知 Cas-OFFinder:基于网络的计算机模拟变异感知潜在脱靶位点识别,可用于基因组编辑应用》,《核酸研究》(2025)。期刊信息: 核酸研究

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