海德堡大学药学和分子生物技术研究所(IPMB)Dominik Niopek教授团队开发了一种新的人工智能模型ProDomino，可预测蛋白质亚基的组装方式，从而设计具有特定功能的人工蛋白质。该研究成果发表于《自然方法》杂志，为生物技术和医学领域提供了新的研究工具。

蛋白质是细胞的“分子机器”，由多个结构域(亚基)组成，负责能量代谢、遗传物质合成等关键功能。Niopek教授团队受自然界蛋白质进化启发，利用AI模型模拟结构域重组，开发出开源工具ProDomino。该工具通过分析超过10万种蛋白质的数据集，预测最优结构域组合，以构建功能可控的新型蛋白质。

研究团队已将ProDomino应用于实际案例，例如将化学敏感域与CRISPR-Cas系统结合，生成可调控的基因编辑工具。课题组长Jan Mathony博士表示：“这些混合蛋白质能精准开启或关闭，可提升基因组编辑的安全性。”目前，该模型已在多种蛋白质上验证，并开放给全球科研人员使用。

Niopek教授指出：“ProDomino不仅简化了人工蛋白质的制备，还提高了设计的精准度，为生物医学应用开辟了新路径。”未来，该技术或推动定制化治疗方法的发展。

更多信息： Benedict Wolf 等人，通过计算机预测结构域插入位点实现变构蛋白开关的合理工程化，《自然方法》(2025)。期刊信息： 《自然方法》