活细胞作为非平衡系统,通过DNA转录RNA等单向过程消耗能量维持生命。测量基因转录不可逆性在个体基因动态中的表现,一直是科学研究的挑战。

圣塔菲研究所博士后研究员James Holehouse在《npj Complexity》发表论文,开发了基于基因表达二态模型的分析工具。该模型将基因状态分为活跃或不活跃,捕捉转录过程中的切换行为。这一方法允许计算基因的熵产生率,评估转录行为与不可逆过程的相似程度。
通过粗粒度方法分析小鼠基因数据集,Holehouse发现基因倾向于规避与高熵产生相关的参数组合。这表明基因表达可能受物理约束影响,使高介观熵产生过程不利,类似于基因层面的能量消耗优化。研究结果为探索非平衡约束如何影响基因表达提供了新方向。
出版详情:作者:Santa Fe Institute;标题:《Measuring irreversibility in gene transcription》;发表于:《npj Complexity》(2026);期刊信息:《npj Complexity》。












