美国新型机器学习方法X-RAI实现分子三维实时重建
2025-11-24 14:06
来源:SLAC国家加速器实验室
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美国能源部SLAC国家加速器实验室研究人员开发出名为X-RAI的新型机器学习方法,为蛋白质或病毒研究带来新突破。该方法基于摊销推理,能“观察”数百万张X射线激光图像,创建目标粒子三维重建模型。研究成果发表于《自然通讯》杂志,X-RAI处理数据集能力强大,“几乎没有限制”,有望突破数据采集限制,让研究人员近距离观察分子及其运动。

图示为XFEL SPI图像采集过程以及我们算法的后续在线处理。

传统上,在SLAC直线加速器相干光源(LCLS)进行的研究,需用X射线脉冲轰击样品获取二维散射图像,再组合重建分子三维结构。但此过程耗时,需数十万到数百万张图像,且随着数据累积,传统算法运行速度变慢,计算延迟限制了研究人员实验时间。为解决此问题,研究团队开发出新机器学习程序X-RAI,可实时处理X射线激光数据并不断改进。

X-RAI神经网络能“观察”二维图像预测三维方向,也能反向工作,优化二维数据与三维重建关系。数据越多,理解越深入,效率越高。研究第一作者杰伊·舍诺伊称,对于大型数据集,X-RAI比其他程序“快得多”,能实时处理每秒多达160张图像,预测物体三维结构。与两种算法比较,X-RAI重建生物分子3D结构效果更清晰。

研究团队希望X-RAI帮助用户更有效利用LCLS及世界各地其他X射线激光器实验时间,在竞争激烈的实验时间分配中,提升使用效率。X-RAI或开启快速分析近乎无限量数据大门,助力研究运动中粒子,如重建酶与药物相互作用“电影”。随着X射线成像技术进步,分子运动方式或能更准确了解。

更多信息: Jay Shenoy 等人,《基于在线机器学习的 X 射线单粒子成像可扩展 3D 重建》,《自然通讯》(2025)。期刊信息: 《自然通讯》

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