科学家开发全新酶设计方法推动绿色化学发展
2025-05-14 10:57
来源:加州大学圣巴巴拉分校
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美国加州大学圣巴巴拉分校、加州大学旧金山分校和匹兹堡大学的研究团队在《科学》杂志发表最新成果,开发出一套全新的酶从头设计工作流程。该方法通过人工智能辅助蛋白质设计,可构建具有特定功能的定制酶,为制药和材料科学领域带来更环保、高效的催化解决方案。研究人员的蛋白质从头设计工作流程始于使用螺旋束作为新蛋白质的框架(左图),利用人工智能设计所需蛋白质结构所需的氨基酸序列,再利用X射线晶体学评估最终的蛋白质结构,最后利用行之有效的方法和“化学直觉”进一步完善设计,直至达到最优设计(右图)

研究团队采用螺旋束蛋白作为框架,结合AI算法设计氨基酸序列,成功开发出能够催化碳-碳键和碳-硅键形成的酶。加州大学圣巴巴拉分校化学教授杨阳表示:"通过与DeGrado团队和刘团队合作,我们建立了一个将简单微型蛋白转化为高效高选择性酶的工作流程。"该设计克服了天然酶在反应条件和底物范围上的限制,同时保持了优异的催化效率。

在优化过程中,研究人员发现初始设计的酶活性不足。通过X射线晶体学分析和环搜索算法改进,最终获得4种具有高活性和立体选择性的酶变体。杨阳指出:"尽管AI设计方法很有用,但要获得优质催化剂仍需结合算法和化学直觉。"这种定制酶可在水相环境中工作,使用多种辅助因子,包括自然界不存在的类型,为绿色化学提供了新可能。

该技术有望应用于药物合成、材料制备等领域,实现传统方法难以完成的化学反应。研究团队计划进一步开发更简单高效的酶变体,探索自然界未知的催化机制。

更多信息: 侯凯鹏等,《从头设计含卟啉蛋白质作为高效立体选择性催化剂》,《科学》(2025)。期刊信息: Science

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