获得数十亿美元资金支持的AI药物研发公司Xaira Therapeutics近日发布了其首个虚拟细胞模型X-Cell,该模型参数规模达49亿,旨在预测细胞在未知生物环境中对基因扰动的反应。团队表示,这一工具可应用于靶点发现、患者分层及毒性预测等领域。

X-Cell作为虚拟细胞领域的创新模型,实现了T细胞失活扰动的零样本预测,并能泛化至训练数据中未见的治疗相关环境。该研究已作为预印本发布于bioRxiv平台,尚未经过同行评审。
Xaira成立于2024年,由前斯坦福大学校长Marc Tessier-Lavigne博士领导,团队包括诺贝尔奖得主David Baker博士等专家。公司通过构建大规模CRISPRi Perturb-seq数据集X-Atlas/Pisces来训练X-Cell,该数据集包含2560万个细胞,覆盖多个生物环境。
在架构上,X-Cell采用扩散语言模型,通过迭代优化预测细胞反应,这与自回归方法形成对比。Xaira生物医学AI高级副总裁Bo Wang博士解释:“扩散模型更复杂,预测能力更强,在推理方面表现更佳。”
Tessier-Lavigne指出:“衡量成功的最佳标准是展示我们的模型能够应用于制造药物并为患者带来改变。”公司目标是将药物发现从手工状态转变为工程学科,除了虚拟细胞模型,还专注于基于蛋白质设计技术的分子开发。
尽管虚拟细胞模型为生物学理解提供了进展,但预测患者结果仍需进一步研究。Noetik首席执行官Ron Alfa医学博士表示:“我们有点痴迷于细胞,如果我们训练先进的AI模型,我们关心的是底层数据产生的标记。”Xaira计划扩展模型至更复杂系统,如动物和患者水平,以推动预测性生物学模型的发展。









