维度网讯，NVIDIA发布了NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit，这是一套专注于生命科学AI工作流的领域专用工具包。
该工具包整合了NVIDIA在过去十多年间开发的生命科学库、工具和开放模型，旨在辅助AI智能体、科学家和实验室处理科学数据，包括收集证据、分析发现、运行计算实验以及推荐后续步骤。
该工具包可用于通用助手、科学智能体、软件平台和内部生物制药系统，提供总结科学知识、调用模型、评估结果、推理发现以及执行后续任务的工具。
该工具包包含NVIDIA BioNeMo，并采用NVIDIA NIM微服务（NVIDIA NIM microservices）、NVIDIA Parabricks、NVIDIA NeMo和NVIDIA Nemotron技术，以及加速计算工具。
超过50家公司正在使用该工具包进行工作流，涵盖蛋白质结构预测、分子对接、生成化学、基因组分析、蛋白质设计和生物标志物发现等方向。
Arc Institute、Open Molecular Software Foundation和华盛顿大学蛋白质设计研究所（University of Washington’s Institute for Protein Design）等机构正在与NVIDIA合作，将BioNeMo应用于研究模型，并通过基于智能体的工作流使其可用。NVIDIA表示，与蛋白质设计研究所的合作改进了RosettaFold3等模型的运行时性能，性能约为上一代模型的两倍。
生命科学研究涉及科学和制药机构庞大的研发预算。基于智能体的工作流有助于研究人员更快地迭代、降低成本并提高科学工作的效率。NVIDIA表示，该工具包允许开发者将通用智能体调整为生命科学用途，帮助研究人员更快地运行实验、从结果中学习并缩短假设与分析之间的周期。一些公司还将这些工作流扩展到物理实验室环境中。
通用智能体可能难以处理科学工作流，因为它们必须推断正确的工具、输入、输出和生物学背景。NVIDIA表示，BioNeMo Agent Toolkit旨在帮助智能体选择合适的工具、解释结果并支持科学分析。
NVIDIA正在调整BioNeMo平台，以便智能体可以直接调用库、模型和框架。这包括用于推理的NVIDIA Nemotron开放模型、用于强化学习的NVIDIA NeMo RL库，以及用于能够在任务间协作、调用工具和与数据交互的智能体的NVIDIA NemoClaw蓝图。
NVIDIA NIM微服务用于模型访问和任务执行。NVIDIA OpenShell运行时为这些工作流提供执行环境。
该工具包支持的工作流包括：虚拟筛选，智能体通过生成和筛选化合物、将其对接到靶点、预测结合强度并过滤类药性，帮助识别小分子候选药物，系统随后对候选化合物进行排名以供进一步审核；基因组分析与靶点发现，智能体将测序数据处理为优先级的遗传发现和生物靶点，NVIDIA Parabricks用于比对和变异检测，基因组基础模型对变异效应进行评分，智能体对候选靶点进行排名以供进一步研究；蛋白质结合剂设计，智能体帮助研究者在实验室工作开始前设计并计算评估候选结合剂；生物医学研究工作流，智能体将数据源与推理模型连接，用于文献综述、方案生成、临床试验筛选和药物警戒等任务；医学影像分析，智能体处理、分割、合成和分析医学影像数据，用于生物标志物发现和证据生成等工作流。
技术和生命科学领域的公司正在使用该工具包进行基于智能体的工作流。科学智能体开发者，包括Anthropic、Edison Scientific、Lila Sciences、OpenAI和Owkin，正在与BioNeMo集成用于研究和分析工作流。NVIDIA表示，其模型和分析库有助于缩短假设生成与结果之间的时间。
数据和工具平台，包括Benchling、Certara、Databricks、Snowflake和Seqera，正在使用BioNeMo Agent Toolkit将科学数据系统与AI工作流连接起来。BioNeMo工具可帮助智能体查询生物和化学数据集、准备模型输入、启动可重复的工作流、分析输出并在科学家和数据团队使用的平台内返回结果。
诊断和制药公司，包括礼来（Lilly）和Natera，正在将其发现、转化研究和临床分析相关工作流中使用BioNeMo Agent Toolkit。专注于生物学的AI公司，包括Boltz、Basecamp Research、Chai Discovery、Dyno、PerturbAI和Proxima，已与NVIDIA合作开发基于模型的治疗设计工作流工具。药物发现软件公司，包括达索系统（Dassault Systèmes）、Cadence（OpenEye）和薛定谔（Schrödinger），正在将工具包功能整合到发现工作流中使用的科学应用中，使得智能体能够在现有软件环境中协调分子生成、对接和预测任务。实验室仪器和自动化公司，包括Automata、HighRes、帝肯（Tecan）、赛默飞世尔（Thermo Fisher）和Medra，正在使用BioNeMo工具将实验室系统与计算工作流连接起来。AI云和基础设施提供商，包括Baseten、Modal和Nebius，正在使用该工具包支持托管的生命科学工作流，提供API、托管计算和推理环境，旨在支持为研究人员和企业部署基于BioNeMo的应用。
BioNeMo Agent Toolkit及其技能现已通过NVIDIA开发者资源页面和GitHub提供。
